Здравствуйте, Александр!

Ситуацию проанализировали.

Пока не будет реализована функциональность выбора партии из доступных по продукту в Себестоимости предлагаем следующий вариант:

1. После списания подписания Реализации товаров и услуг система автоматически сформирует партии по товарам из данной реализации переходите к этом списку либо из карточки реализации, либо на вкладке в режиме Реализации товаров и услуг. 
2. Открываете партию нужного товара и переходите в разделе "Откуда" к выбору документа и продукта в нём. 
3. Устанавливаете курсор на документ (например накладная если выбран вид источника Накладная от поставщика). Для открытия справочника или перехода к поиску в нём нажимаете F2 и там находите требуемую накладную.
4. Для выбора продукта в документе достаточно либо прокрутить колесиком мыши в этом ссылочном атрибуте, либо нажать типовое сочетание клавиш Alt+Стрелка_вниз
5. При этом цену, кол-во и сумму Вы сможете изменять вручную.
6. Так же при необходимости партии Вы можете добавлять самостоятельно - себестоимость и доходность пересчитается автоматически.

Мы постараемся подготовить документацию максимально быстро.
Вас известим обязательно.

"КлиК-Управление: БАЗОВАЯ" не содержит в себе складского учета и расчета себестоимости товаров. В остальном конфигурации работают на единых правилах. Соответственно вполне разумно использовать мануал от этой конфигурации в данный момент по всем функциям, которые не затрагивают складской учет.

В "Управление: ТОРГОВЛЯ" партией считается документ-накладная от поставщика. Каждая партия доступна для отгрузки из неё клиентам. По умолчанию подстановка партий осуществляется автоматически по методу FIFO в момент установки состояния в значение "Подписан". "Ручного" указания из какой партии осуществлять отгрузку в реализациях на данный момент не предусмотрено. 

В планах развития конфигурации заложен инструментарий с возможностью указания прямых ссылок на ещё доступные партии выбранного товара в отгрузке. По срокам реализации сориентировать могу только на этот год (более точной информации, к сожалению сейчас нет).